Als een van de invloedrijkste mecenassen van haar tijd beschikte Margaretha over een indrukwekkend corpus muziekhandschriften met repertoire van de meest toonaangevende componisten van dat moment. Zo geldt het Mechels Koorboek, een luxueuze codex afkomstig uit het atelier van Petrus Alamire, misschien wel als een van de bekendste bronnen die met het Habsburg-Bourgondische hof wordt geassocieerd.

Tot op vandaag wordt het koorboek nog steeds bewaard in de stad waarvoor het werd vervaardigd, waar Margaretha als landvoogdes van de Habsburgse Nederlanden verbleef. Het is vanuit het hof van Savoye te Mechelen dat Margaretha ook de bouw van het imposante Augustijnenklooster in Bourg-en-Bresse zou opvolgen. Zelf zou ze nooit het voltooide resultaat kunnen bewonderen: ze overleed in 1530, twee jaar voor de laatste steen werd gelegd. Het Monastère royal de Brou, dat het leven en cultuurpatronaat van zijn stichteres centraal stelt, presenteert sinds kort een facsimile van het Mechels Koorboek op de prachtige houten staander in het koor van de kloosterkerk. De Alamire Foundation vervaardigde deze uiterst gedetailleerde facsimile op ware grootte binnen de reeks Leuven Library of Music in Facsimile. Op deze manier wordt een brug geslagen naar het muzikale erfgoed dat er eeuwen geleden had kunnen weerklinken.